在数控系统中控制轴的数量是关键的选择。中走丝线切割的控制轴数，可以分为两轴联动、四轴联动、多轴联动等，而控制轴的数量越多，机器可以处理的形状越复杂，而线切割机的成本也就越高。

目前，中走丝线切割机一般为四轴联动，有两个线性运动轴连接和锥形装置增加的两个线性运动轴，而高端系统拥有的轴更多。 水平的线切割机床制造的是五轴联动数控系统，四个轴是XYUV线性移动轴，一个轴是Z轴，用于上下移动线性轴，另外还有一种W轴，如苏州宝玛集团生产的轮胎模具专用中走丝电火花线切割机。线切割机的五轴联动可以加工更复杂的空间部件，当然这是需要高端数控系统、系统和软件的支持，同时对中走丝机的要求也非常高。在未来的发展趋势中，线切割机还会加入，自动放料，来加工一些形状简单的材料（不需要拆除钼丝）。

中走丝线切割的控制轴越多，CNC系统的价格就越高。因此，在选择数控系统时，需要根据机床的运动轴进行选择。多余的控制轴不仅不会提高中走丝的控制精度，反而会增加中走丝线切割机的维护成本，比如大锥形中走丝机在选择不当时会大大增加线切割机的维护复杂性和维护成本。